1 bibliography: [book.bib, packages.bib]
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1.1 DESCRIPCIÓN DEL CURSO
1.1.1 OBJETIVOS
1.2 Evaluación
1.2.1 tareas
1.2.2 proyectos
1.2.3 calificaciones
1.3 Calendario
1.3.1 Módulo 1: Introducción a R y RStudio
1.3.2 Módulo 2: R Markdown & Github
1.3.3 Módulo 3: Manipulación de Datos con Tidyverse
1.3.4 Modulo 5: Visualización de Datos
1.3.5 Módulo 6: Introducción al Análisis Geoespacial
1.4 Recursos adicionales
2 Introducción
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2.1 Objetos
2.2 Variables
2.2.1 Tipos de variables
2.3 Funciones
2.4 Vectores
2.5 Instalar librerías
2.6 R Notebook
2.7 Leer datos
2.8 Ejercicios
3 Principios de Tidydata
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3.1 Definiciones
3.2 Lógica y funciones
3.2.1 Funciones esenciales
3.2.2 pipe
3.2.3 Agrupar
3.2.4 Filtrar
3.2.5 Crear nuevas variables
3.2.6 Responder:
3.3 Cambiar formato de tabla
3.3.1 ¿Podemos explicar que sucedió aquí?
3.4 Ejercicio
3.5 Bonus (Esto requiere investigar no basta con lo que aprendimos)
3.6 Recursos
4 RMarkdown
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4.1 ¿Qué es R Markdown?
4.2 Librerías
4.3 Crear un R Markdown
4.4 Encabezado YAML
4.5 Sintáxis de Markdown
4.5.1 Lo esencial
4.5.2 Listas
4.5.3 Mostrar ejemplos de de código (sin ejecutarlos)
4.5.4 Figuras
4.6 MD -> HTML
4.7 Código R
5 Uso de R como Sistema de Información Geográfico
5.1 Clasificación de mapas y manejo de cartografía
Algunos insumos para manejo de cartografía que usaremos:
5.2 Usos de suelo para Chile
Importamos raster de cobertura de usos de suelo para Chile. Esta cobertura viene del lab de Jaime Hernandez en la U de Chile y esta documentada aqui y disponible aqui.
Luego de descargar los datos y descomprimirlos en nuestro directorio de trabajo podemos “cargar” el archivo TIF como un objeto en R
Miremos la descripcion del archivo, fijemosnos en qué sistema de coordenadas está.
chiler
#> class : SpatRaster
#> dimensions : 144511, 23799, 1 (nrow, ncol, nlyr)
#> resolution : 30.00002, 29.99993 (x, y)
#> extent : -8139.377, 705831, 3730098, 8065417 (xmin, xmax, ymin, ymax)
#> coord. ref. : WGS 84 / UTM zone 19S (EPSG:32719)
#> source : LC_CHILE_2014_b.tif
#> name : LC_CHILE_2014_b
#> min value : 0
#> max value : 1210Vemos que sus coordenadas están definidas en UTM 19S
Podemos también ver los datos con plot().
5.3 Región de los Ríos
Esta es una cobertura en formato KML de la región de los ríos.
Fuente: aqui.
dir =
reg = st_read("/home/horo/Dropbox/cursos/uach/CBIT241/practicos/Metricas2/Regional.shp") %>%
filter(Region=='Región de Los Ríos')
#> Reading layer `Regional' from data source
#> `/home/horo/Dropbox/cursos/uach/CBIT241/practicos/Metricas2/Regional.shp'
#> using driver `ESRI Shapefile'
#> Simple feature collection with 17 features and 7 fields
#> Geometry type: MULTIPOLYGON
#> Dimension: XY
#> Bounding box: xmin: -12184470 ymin: -7554436 xmax: -7393642 ymax: -1978920
#> Projected CRS: WGS 84 / Pseudo-Mercator
plot(reg["Region"], axes = TRUE, graticule = TRUE)
5.4 Unificamos proyección geográfica
Ahora debemos reproyectar a UTM19 (epsg:32719)
r14_utm = reg |>
filter(Region == 'Región de Los Ríos') |>
st_transform(crs=32719)
plot(r14_utm["Region"], axes = FALSE, graticule = TRUE)
Podemos usar la provincia de Valdivia, del Ranco o de Chiloe en vez de toda la región
fuente: Provincias.zip
prov = read_sf("/home/horo/Dropbox/cursos/uach/CBIT241/practicos/Metricas2/Provincias.shp") %>%
dplyr::select('Provincia') %>%
dplyr::filter(Provincia == 'Chiloe') %>%
st_transform(crs=32719)
#vald=st_transform(prov[prov$Provincia=='Valdivia',],crs=32719) # reproyeccion a UTM19S !!
#ranco=prov[prov$Provincia=='Ranco',]
par(mfrow=c(1,2))
plot(prov, axes = TRUE, graticule = TRUE)
Ojo que solo hemos reproyectado la provincia de Valdivia y no Ranco!
5.4.1 Comunas de Chile
#library(curl)
#com_tmp = tempfile()
#com = curl_download("https://www.bcn.cl/obtienearchivo?id=repositorio/10221/10396/2/Comunas.zip",com_tmp)
#unzip(com)
lr = read_sf("/home/horo/Dropbox/cursos/uach/CBIT241/practicos/Metricas2/comunas.shp") %>%
dplyr::filter(Region == 'Región de Los Ríos'| Region == 'Región de Los Lagos') %>%
dplyr::select(Comuna, Provincia, Region) %>%
st_transform(crs=32719)En R existen librerías que permiten la visualización interactiva como mapview